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产品选择问题

DNA提取系列产品介绍及选择指南~

首先询问和确定客户提取的大致样本种类,是动物组织细胞?植物?血液样本?真菌?细菌?病毒?酵母?
——根据客户需要提取的不同样本种类,给客户推荐和选择不同的DNA提取试剂盒产品。
1. 血液样本:
注意:爱普科学的溶液型血液基因组DNA提取,小量(BE202),中量(BE301),大量(BE401)这三种盒子里面成分实际完全一样,就是分量不同,然后配了小量,中量,大量3种不同样本处理量的说明书。任何一种盒子,都可以按照比例放大或者缩小提取,小量,中量,大量或者说任意量的血液样本。也就是说小量的比如0.3ml x 50次的盒子,一次提取0.3ml可以提取50次,也可以一次提取3ml可以提取5次,也可以一次提取5ml可以提取3次。大量的比如10ml x 16次,一次提取10ml可以提取16次,也可以一次提取1ml可以提取160次,也可以一次提取0.3ml可以533次。中量的盒子以此次类推。
A: 新鲜的抗凝血液或者冰箱冻存的抗凝血液(抗凝良好,未凝固)
1) 样本<200µl:首选BE201 AipBest 全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(离心柱型)。离心柱型速度快,方便。次选BE202 AipBest 全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(溶液型)。溶液型稍繁琐对操作要求高些,但是便宜,和可以提取更大分子量的基因组DNA,更适合建文库使用。
2) 样本>200µl 但是<500µl:首选BE201AipBest全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(离心柱型)。但是需要同时定购一个红细胞裂解液。次选BE202 AipBest 全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(溶液型)。
3) 样本>500µl 但是<20ml:样本超过500µl尤其是超过1ml的情况下,一般会超出小量离心柱子处理范围,因此一般不能选用离心柱型的BE201,而要选择溶液型的产品如BE301,BE401,具体选择哪款就看总共处理多大量了, 比如一次提取1ml, 但是要提取60个样本, 就可以选择中量BE301,如果一次提取1ml,但是要提取160个样本,可以选择大量BE401,当然也可以选择3个中量的盒子,就是贵了不合算。如果一次提取10ml,但是只提取5个样本,也可以选择中量的BE301,选择大量的最小包装也可以提取10ml x 16次,就浪费了。
B: 抗凝不完全导致含有血凝块血液(凝固血)
1) 样本<200µl:首选BE201 AipBest 全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(离心柱型)。就是添加一个操作,在操作前用枪头捣碎血凝块后按照正常步骤进行。次选BE502 AipBest 凝固全血基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。
2) 样本>200µl 但是<500µl:首选BE201 AipBest 全血基因组DNA快速小量提取试剂盒(离心柱型)。但是需要同时定购一个红细胞裂解液,捣碎血凝块后先用红细胞裂解液处理后按照正常步骤进行,可以问我们索取专门用于凝固血的BE201的说明书(凝固血专用)。次选BE502 AipBest 凝固全血基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。
3) 样本>500µl 但是<20ml:样本超过500µl尤其是超过1ml的情况下,一般会超出小量离心柱子处理范围,因此一般不能选用离心柱型的BE201, 只能选择BE502 AipBest 凝固全血基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。
总结:一般200µl左右的小量血液提取,首先推荐BE201,超过0.5ml尤其是超过1ml血液只能选择溶液型的中量BE301和大量BE401血液提取。全血基因组DNA提取为优势产品,比起其他公司如天根产品有明显优势,离心柱型的纯度高,可用于芯片制作。溶液型的技术也更好,和凯杰Qiagen,罗氏Roche,普洛麦格Promega的原理配方说明书操作完全一样,不用蛋白酶K消化,(天根并未掌握该技术,还是用蛋白酶K消化,所以纯度低,步骤繁琐)。无论是离心柱型还是溶液型的血液基因组DNA提取产品,爱普科学提取的DNA均可用于芯片制作,具有明显的产品优势。
2. 植物样本:
植物千变万化,种类繁多,非常复杂,世界上任何一家公司任何一种试剂盒也无法确保100%提取成功。下面分别介绍几个植物DNA提取试剂盒。
1) PD202 AipBest CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型),这个是传统CTAB法植物DNA提取方法的改良,并添加了离心柱子设计,简化了操作步骤,缩短了操作时间,提高了纯度。优点在于适应性广泛,包括很多复杂的多糖多酚,次级代谢产物丰富的或者干粉植物样本也可以提取。缺点是用到了氯仿毒性物质。和PD204 AipBest 新型植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)比较起来提取速度也稍微要慢一些。对应天根生化的货号是DP305植物基因组DNA提取试剂盒。
2) PD204 AipBest新型植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型),这个是世界上目前最快速,无毒的植物DNA提取试剂盒。相当于Qiagen的DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen货号:69104),原理,配方,操作步骤几乎完全一致,说明书都可以通用;优点是操作最简单,速度最快,而且不用氯仿等毒性物质;缺点是适应性或者广泛性差一些,和PD202比较起来,对于某些多糖多酚次级代谢复杂或者干燥保存的植物样本效果可能不理想。一般更多用于新鲜,简单的植物样本(比如棉花、烟草、水稻、玉米、小麦、拟南芥等农作物)。对应天根生化的货号是DP320 新型植物基因组DNA提取试剂盒。
3 )PD201 AipBest 植物基因组DNA快速提取试剂盒(溶液型),这个就是PD204的简化版本,为了节约成本,给客户一个更多的选择,PD204减少离心柱子的版本就是PD201。不过一般不加离心柱子后,操作速度和提取效果会比PD204要差一些。优点是溶液型的,可以任意的放大,缩小处理量,可以灵活用于小量,中量,大量提取。对应天根生化的货号是DP321快捷型植物基因组DNA提取系统。
总结:一般情况下,首先选择PD202和PD204产品。具体又分两种情况:一种情况客户自己知道原来用的方法或者用过天根同类试剂盒的,可以问客户原来是使用什么方法或者试剂盒提取。如果是用传统的CTAB法手工提取或者客户以前使用的是天根的DP305,就可以推荐我们的PD202。如果客户以前是用Qiagen的69104或者使用天根的DP320,就可以推荐我们的PD204。另一种情况是客户以前没有用过试剂盒或者也没有用过CTAB法手工提取,就是完全不知道怎么选择的情况下,如果是棉花、烟草、水稻、玉米、小麦、拟南芥叶片等简单样本或者茶树叶片、苹果叶片、梨树叶片、桉树叶片等提取过确定可以提取的情况下肯定可以首选推荐PD204,如果客户的样本明显是复杂多糖多酚,次级代谢产物多或者是干燥保存样本,那就首先推荐PD202。如果分不清楚是复杂多糖多酚样本还是简单样本,可以务必事先和爱普科学业务人员沟通,看看如何推荐。
3. 真菌样本:
● 首选OD205 AipBest 真菌基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。实际上OD205 AipBest 真菌基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)=PD204 AipBest 新型植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型),没错,真菌本来就是应该用PD204 AipBest 新型植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)来提取的(进口Qiagen试剂盒都是植物DNA提取试剂盒提取真菌的)。 对于提取真菌样本,这个盒子OD205(和PD204一样)和Qiagen的69104 DNeasy Plant Mini Kit完全一样。Qiagen的69104产品提取植物细胞、组织或真菌细胞样本分离总DNA最高产量可达30 µg,无污染物和酶抑制剂,快速纯化得到即用型纯DNA,无需有机抽提,无需乙醇沉淀,客户要搞不清楚就去Qiagen官网下载原版的说明书看看就行了,确保OD205(PD204)和Qiagen的69104完全一样。但是如果碰到特别复杂的真菌种类,多糖多酚代谢产物特别复杂,OD205(PD204)效果不好,就要试试PD202 AipBest CTAB植物基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型)。
4. 织细胞、鼠尾、软骨、昆虫、等样本(包括保存在酒精里面的):
1) 小量提取首选TD201 AipBest 组织/细胞基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型);
2) 中量、大量提取首选TD202 AipBest 组织/细胞基因组DNA提取试剂盒(溶液型)。
5. 细菌样本:
1) 无论革兰氏阳性菌还是阴性菌首选BD201 AipBest 细菌基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型);
2) 中量大量可以选择BD203 AipBest 细菌基因组DNA中量/大量提取试剂盒(溶液型)。
6. 酵母样本:
1) 小量提取首选YD201 AipBest 酵母基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型);
2) 中量、大量提取首选YD203 AipBest 酵母基因组DNA中量/大量提取试剂盒(溶液型)。
7. 病毒DNA样本(从血浆,血清,体液等无细胞体系):
● 首选OD207 AipBest 病毒基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型),另外也可以用RE251 AipPure Plus 病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒(离心柱型)。
8. 粪便样本:
● 首选OD206 AipBest 粪便基因组DNA快速提取试剂盒(离心柱型),该款试剂盒的原理、方法、操作步骤、提取效率和Qiagen的QIAamp DNA Stool Mini Kit(货号:51504)完全一致。从粪便中纯化最多30μg 基因组、细菌、病毒和寄生虫DNA,可快速纯化高品质即用型DNA,无有机提取或乙醇沉淀,持续的高产量,彻底去除污染物和下游反应抑制物。
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