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AipPure 细菌miRNA快速提取试剂盒

货号:MR208-01

品牌:爱普科学

货期:现货

价格:2280

50T
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适用范围:适用于快速提取细菌/外泌体等microRNA或microRNA/总RNA分别提取

产品储存:本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。不合适的储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

产品介绍:

    本试剂盒在我公司领先的RNA/microRNA提取技术的基础上,创新性的采用了不用苯酚、氯仿等有毒试剂的技术路线,精心研制而成。传统的microRNA提取试剂盒均是采用异硫氰酸胍/苯酚/氯仿(TRIzol法)加高浓度乙醇硅胶膜吸附小片段microRNA的原理方法制成,但是该方法因为使用了有毒的苯酚/氯仿,因其对身体的毒性致癌作用和环境保护的影响受到越来越多的限制。同时TRIzol法原理适用范围窄,对于某些特殊样品(包括细菌样本),提取microRNA效果不佳。

    本试剂盒配备了独特的通用裂解液,可迅速裂解细菌和灭活细菌RNA酶,然后裂解混合物通过基因组DNA清除柱,基因组DNA被清除而RNA(包括microRNA)被选择性滤过。滤过的RNA/microRNA用乙醇调节结合条件后,在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列特殊漂洗液快速的漂洗-离心的步骤,将细胞代谢物和蛋白等杂质去除,最后低盐的RNase-free Water将纯净的RNA(包括microRNA)从硅基质膜上洗脱。

    本试剂盒采用分提取操作步骤也可单独纯化富集后的microRNA组分和总RNA(>200 nt),从而得到分离富集的microRNA和RNA。

产品特点:

1. 操作安全,完全不使用有毒的苯酚、氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤

2. 快速简捷,全程操作只需12步,单个样品操作一般可在40分钟内完成,比传统 microRNA提取试剂盒大大减少了操作时间和步骤

3. 功能强大,既可以得到总RNA(包含了microRNA),也可以采用分提取操作步骤单独纯化富集后的microRNA组分和总RNA(>200nt),从而得到分离富集的microRNA和RNA

4. 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达2.0~2.2,可直接用于RT-PCR、荧光定定量PCR、Northern-Blot等相关分子生物学实验

注意事项:

1. 第一次使用前请先在Wash Solution 1瓶和Wash Solution 2/3瓶中加入指定量乙醇,加入后请及时打钩标记已加入乙醇,以免多次加入。Wash Solution 2/3可能加入乙醇使用几天后出现沉淀晶体,并不影响使用,直接不吸晶体,吸上清使用即可。

2. 所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可在37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。

3. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子密封保存。

4. 所有的离心步骤均可在室温完成(4℃离心也可以),使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机。

5. 需要自备乙醇,研钵(可选)、Lysostaphin(样品为金葡菌时需准备)等。

6. 样品处理量绝对不要超过基因组DNA清除柱和RNA吸附柱RA处理能力,否则造成DNA残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品DNA/RNA含量时可使用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。

7. 裂解液ALB和Wash Solution 1中含有刺激性化合物,操作时需穿防护服并佩戴一次性手套,避免沾染皮肤、眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

8. 预防RNase污染及实验前的准备:经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。使用RNase-free的塑料制品和枪头避免交叉污染。RNA提取过程中应使用RNase-free的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料器皿可在0.5M NaOH 中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。配制溶液应使用RNase-free的水或DEPC水(DEPC水的制备:将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1%(v/v),37℃放置过夜,高压灭菌)。

9. 关于DNA的微量残留:一般说来任何总RNA提取试剂在提取过程中无法完全避免DNA的微量残留(DNase消化也无法做到100%无残留),该产品由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组DNA清除柱技术,绝大多数DNA已经被清除,个别特殊情况需要清除微量基因组DNA残留,可使用以下几种DNA酶消化的方式。

1) 传统DNA酶消化提取的RNA/microRNA,热灭活DNA酶后直接用于后续实验。

2) 传统DNA酶消化提取的RNA/microRNA,然后使用增强型RNA清洁纯化试剂盒(货号:RE282)清洁纯化后用于后续实验。

3) 直接在吸附柱RA上进行DNase I 柱上消化处理。可购买爱普科学的AipPure DNase I柱上消化试剂盒(RNase-free)(货号:RE280),但是需将说明书的去蛋白液 RW1改成Wash Solution 1,可先索取具体操作说明书。

操作步骤(提取包含microRNA的总RNA):

提示:第一次使用前请先在Wash Solution 1和Wash Solution 2/3瓶中按照标签提示加入指定量无水乙醇!并打钩做好标记避免重复加入!提取细菌RNA需先配制加了溶菌酶或Lysostaphin的TE溶液(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA),确保TE溶液中已加入溶菌酶或Lysostaphin(浓度为1mg/mL)。

1. 离心收集1-2mL菌液(108-109细胞)到新的1.5mL离心管, 尽可能去除上清。

2. 根据细胞的种类和数量,充分重悬细胞在100μL(5*108细胞)/200μL(5*108-7.5*108细胞)TE溶液中(10mM Tris-HCl,1mM EDTA),确保TE溶液中已加入溶菌酶或 Lysostaphin(浓度为1mg/mL)或者直接用TE溶液重悬后,用干净枪头挑取少许溶菌酶加入。

3. 室温(15-25℃)温育5分钟/溶菌酶,或者 37℃温育15分钟/Lysostaphin,破解细胞壁,期间每2分钟涡旋振荡10秒辅助破壁。

注:各种细菌破壁的难易程度不一样,一般革兰氏阴性菌E.coli使用上面的条件就足够了,甚至可能省略该步骤,但是某些革兰氏阳性菌如B. subtilis难破壁需要提高溶菌酶浓度到15mg/mL和温育时间到10分钟。如果金黄色葡萄球菌需要加入 Lysostaphin到1mg/mL,37℃温育15分钟。总之不同细菌类型破壁难易程度不同,有的难破壁的种类需要根据用户自己的具体情况调节酶的种类、工作浓度、温育温度和时间等,此外还可以联合使用玻璃珠击打、机械破壁、蛋白酶K消化等方法帮助破壁。

4. 短暂离心收集细菌,彻底弃上清后加入500μL裂解液ALB,涡旋振荡或者用吸头吹打混匀帮助裂解细菌。

5. 将裂解匀浆液全部加到DNA清除柱上(清除柱放在收集管内)。立即12,000rpm离心 1分钟,收集滤液(RNA/microRNA在滤液中)。

6. 用微量移液器较精确估计滤过液体积(480μL左右,滤过时损失体积应该减去),加入1.25倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

7. 立刻将混合物(每次小于700μL,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)12,000rpm离心30秒,弃掉废液。

注:确保离心后液体全部滤过,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

8. 加入700μL Wash Solution 1(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。

9. 加入500μL Wash Solution 2/3(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。加入500μL Wash Solution 2/3,重复操作一遍。

10. 将吸附柱RA放回空收集管中,13,000rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

11. 取出吸附柱RA,放入新的RNase-free离心管中,根据预期RNA产量在吸附膜的中间部位加30-50μL RNase-free Water,室温放置1分钟,12,000rpm 离心1分钟,洗脱收集RNA溶液,得到的RNA/microRNA可以立即用于下游反应或尽快-70℃保存,防止降解。

注:将洗脱液重新加回到吸附柱按照步骤11重新洗脱一遍,可以提高产量约10-15%。如果预期RNA产量>30μg,加30-50μL RNase-free Water重复步骤11操作,合并两次洗脱液,分两次洗脱合并洗脱液的RNA产量比前者高15–30%,但是浓度要低,用户根据实验需要自行选择。

附录1:microRNA相对富集方法(microRNA/去除了microRNA的总RNA分别提取)

提示:第一次使用前请先在Wash Solution 1和Wash Solution 2/3瓶中按照标签提示加入指定量无水乙醇!并打钩做好标记避免重复加入!提取细菌RNA需先配制加了溶菌酶或Lysostaphin的TE溶液(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA),确保TE溶液中已加入溶菌酶或Lysostaphin(浓度为1mg/mL)。

1. 按照标准操作步骤1-4,准备好裂解匀浆液。

2. 在裂解匀浆液加入一半体积的无水乙醇(0.5 体积),此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。

3. 将混合物(每次小于720μL,多可以分两次加入)加入一个基因组DNA清除柱中,(清除柱放入收集管中)12,000rpm离心2分钟,保留滤液(microRNA 在滤液中)

注:此时滤过液含有microRNA,基因组DNA清除柱内溶液是去除了microRNA的总RNA(不包含microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤 4-8操作漂洗,洗脱回收得到去除了 microRNA 的总 RNA。

4. 将混合物(每次小于720μL,多可以分两次加入)加入一个基因组清除柱中,(清除柱放入收集管中)13,000rpm离心2分钟,保留滤液(microRNA在滤液中)

注:此时滤过液含有microRNA,基因组DNA清除柱内溶液是去除了microRNA的总RNA(不包含microRNA),如果需要,可以按照前面标准操作步骤8-11操作,漂洗、洗脱回收得到去除了microRNA的总RNA。

5. 用微量移液器较精确估计滤过液体积,加入等体积无水乙醇(必须是室温!),涡旋或者吹打充分混匀,不要离心。

6. 立刻将混合物(每次小于700μL,多可以分两次加入)加入一个吸附柱RA中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm离心2分钟,弃掉废液。

注:确保离心后液体全部滤过,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

7. 按照前面标准操作步骤8-11操作,漂洗、洗脱得到富集的microRNA。

注意:不同的实验可以选择不同的方法,例如Northern Blot或者表达芯片谱分析可以选择提取包括microRNA的总RNA。相对富集方法提取的microRNA因为去除了较大片段的mRNA和rRNA等,可能减少某些下游试验的扩增背景,当背景较高或者非特异扩增较多时,可以尝试使用相对富集方法提取的microRNA。总的原则是首选提取使用总RNA(包含了microRNA)做实验,只有确实使用总RNA(包含microRNA)效果不佳的时候,或者实验设计要求必须富集分离microRNA和mRNA,才尝试采用富集microRNA的方法。

附录2:DNA酶柱上消化(详细请参考RE280/DNase I 柱上消化试剂盒说明书)

1. 按照前面所列操作步骤操作,直到做完操作步骤1-7。

2. 取45μL DNase I Buffer和5μL RNase-free DNase I在离心管内轻轻吹打混匀,配制成DNase I工作液

注:处理多个离心柱子要按照比例放大制备工作液。

3. 向吸附柱RA中加入350μL Wash Solution 1,12,000rpm 离心30秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。

4. 向吸附柱RA中央加入50μL的DNase I 工作液,室温(20℃-30℃)放置15分钟。

注:直接将工作液滴在膜中央上向膜四周浸润充分和膜接触,不要让工作液滴在O型垫圈上,或离心柱管壁上挂壁,或挂在垫圈上不能充分和膜接触。

5. 向吸附柱RA中加入350μL Wash Solution 1,12,000rpm 离心30-60秒,弃废液,将吸附柱放回收集管中。

6. 立即接操作步骤9,完成后续实验步骤。

品牌: 爱普科学
英文名称: AipPure Bacterial miRNA Rapid Extraction Kit
规格: 50T
性状: 液体
储存温度: RT
保质期: 12个月
产品说明: 收到产品后,请尽快按照试剂盒内各组分的储存温度保存!
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