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产品储存:-20℃保存,有效期12个月。由于试剂盒中提供的反应缓冲液及dNTP等成份是为反应专门优化的超纯dNTP,所以不要用其它的反应缓冲液及dNTP等代替。
制品说明:本定点突变试剂盒是基于PCR原理向目的DNA片段(一般为质粒)中引入碱基的点突变,多个邻近密码子的突变,单个或多个邻近密码子的缺失(deletion)或插入(insertion)等。一般宿主菌培养扩增的质粒DNA是甲基化的,PCR扩增新合成的DNA是非甲基化的。首先以待突变的甲基化质粒为模板,利用快速超高保真的SuperPfu聚合酶实现突变质粒的合成(非甲基化,包含突变点,且有两个缺刻点nick点),再利用Dpn I酶选择性降解甲基化的模板质粒,剩下的新合成非甲基化的突变质粒转入大肠杆菌后,质粒中有两个nick位点可以被大肠杆菌修复,得到的克隆就会含有预期的突变质粒了。一般可以产生大于90%的突变效率。
适用范围:< 12kb甲基化质粒中核苷酸的突变。
产品特点:
1. 简单方便,一个PCR管中完成所有操作,速度最快。
2. 采用部分重叠引物设计,使PCR呈指数扩增,扩增产物凝胶电泳可见增加成功率。
3. 效率高,使用Dpn I去除非突变模板,突变效率高达90%;不需要使用特殊感受态细胞降解非突变质粒。
4. 采用分子进化改造的SuperPfu可以提供4倍-6倍于pfu的扩增速率提高和3倍于pfu的超高保真性。
引物设计:
1. 引物包含5'端重叠区和3'端延伸区。5'端重叠区长度大约18-20bp,3'端延伸区长度大约是10-12bp。
2. 突变位点设计在5'端重叠区的中间位置,突变位点的左侧5'端大约7-9bp,右侧3'端20-22bp。
3. 引物应该选择PAGE或者更高的纯化方式,3'端为一个或者更多个G/C结尾。
4. 举例:氨基酸V(GTA)连续突变3个碱基成为R(CGT)
建议PCR条件(25μL反应体系) :
Template | 2-10ng |
Forward Primer(10μM) | 1μL |
Reverse Primer(10μM) | 1μL |
10×SuperPfu Buffer | 2.5μL |
SuperPure dNTP Mix | 0.5μL |
SuperPfu DNA Polymerase | 0.5μL |
ddH2O to final volume | 25μL |
PCR循环:
注意:一般选择2kb/min扩增,但是扩增时间通常可以在1kb/20-40秒范围内调整。
注意:在保证扩增成功的基础上,待突变质粒模板用量越少,DpnI消化越充分,突变阳性率越高。
电泳检测:取5μL PCR产物,1%琼脂糖凝胶电泳检测。如能看见目的条带(或者见到目的条带外还有其它条带),则可预判基本成功;
注意:即使未见条带,也可以继续进行后续步骤,但是成功几率大大降低。
PCR产物的消化:直接加0.5μL Dpn I酶于PCR产物中(约20μL),充分混匀,继续PCR仪器上37℃孵育1小时(不用热盖)。
注意:Dpn I含甘油,易沉底,一定要吹打混匀。如果非突变质粒较多,可以延长消化时间到3-5小时。
转化:加入5-10μL Dpn I酶消化产物于50μL-100μL感受态细胞中(效率≥10的8次方),轻弹混匀,冰浴30分钟。按照标准转化步骤转化,最后将菌液铺板,培养过夜(为得到较多的克隆,4000rpm 离心1min,弃掉部分上清,保留100-150μL,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板,培养过夜)。
注意:应该选择效率高的感受态细胞,如无克隆生长,或克隆数少,可以将20μL消化产物全部转入200μL感受态细胞中,或者把Dpn I酶消化后的产物用常规的乙醇沉淀浓缩,这样就可以把所有的产物全部用于转化。
品牌: | 爱普科学 |
产品别名: | One-Tube Mutagenesis Kit |
规格: | 10次/20次 |
储存温度: | -20℃ |
保质期: | 12个月 |
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