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适用范围:适用于快速提取各种细菌基因组DNA。
产品储存:本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。
储存事项:
1. 结合液CB或者抑制物去除液IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2. 蛋白酶K保存在即用型甘油缓冲液中,常温运输。收到后,不超过25℃室温至少保存6个月,4℃保存12个月,-20℃保存2年。
3. 避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
产品介绍:独特的结合液/蛋白酶K迅速裂解细胞和灭活细胞内核酸酶,然后基因组DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,抑制物去除液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯净基因组DNA从硅基质膜上洗脱。
产品特点:
1. 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。
2. 操作安全,不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
3. 快速简捷,单个样品操作一般可在30分钟内完成。
4. 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280典型的比值达1.7~1.9,长度可达30kb—50kb,可直接用于PCR,Southern-blot和各种酶切反应。
注意事项:
1. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm 的传统台式离心机,如Eppendorf 5415C或者类似离心机。
2. 开始实验前根据需要将水浴预热到37℃或者70℃备用。
3. 需要自备异丙醇。
4. 需自备0.5M EDTA、Triton X-100和Lysozyme(溶菌酶)(用于革兰氏阳性菌)。
5. 结合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
6. 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保批pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱DNA应该保存在-20℃。DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。
关于平衡液的使用:
1. 介绍:核酸吸附硅胶膜柱子长期放置过程中会同空气中的电荷/尘埃发生反应而影响其核酸的结合能力。硅胶柱经平衡液预处理后可大大减少柱子中硅胶膜的憎水基团,提高核酸的结合能力。从而提高硅胶柱子回收效率或者产量。平衡液是强碱性溶液,若不小心碰到,请用大量自来水清洗。用完后需盖紧瓶盖,以免接触空气。室温保存。在保存过程中可能有沉淀生成,请加热至37℃使沉淀完全消失。
2. 使用方法:取一个新的硅胶膜吸附柱子装在收集管中,吸取100μL的平衡液至柱子中。13000rpm 离心1分钟,倒掉收集管中废液,将吸附柱子重新放回收集管。此时平衡液预处理柱子完毕。接后续的操作步骤。
操作步骤(实验前请先阅读注意事项):
提示:第一次使用前请先在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!
1. 取0.5-2毫升培养菌液(最多不超过2×109个细胞),10,000rpm,离心30秒,尽可能的吸弃上清,收集菌体。
注:起始处理量可以根据细菌密度、细胞种类、预期产量进行调整,但是离心吸附柱最大吸附能力是20μg基因组DNA,如果菌体过量超过最大吸附能力,反而会严重降低产量。
2. 加入200μL缓冲液RB重悬,10,000rpm 离心30秒,弃上清。将细胞振荡或者吹打充分重悬于180μL缓冲液RB中。
注:对于较难破壁的革兰氏阳性菌,可略过第2步骤,加入溶菌酶进行破壁处理,具体方法为:加入180μL缓冲液(20mM Tris,pH 8.0;2mM Na2-EDTA;1.2% Triton X-100;临用前加入终浓度为20mg/mL的溶菌酶(溶菌酶必须用溶菌酶干粉溶解在缓冲液中进行配制,否则会导致溶菌酶无活性)),37℃处理30 min以上。
3. 加入20μL蛋白酶K(20mg/mL)溶液,充分混匀,再加入200μL结合液CB,立刻涡旋振荡充分混匀,在70℃放置10分钟。
可选做步骤:如果RNA残留较多,需要去除RNA,可以在加入200μL结合液CB前加20μL RNase A(25mg/mL)溶液,振荡混匀,室温放置5-10分钟。
平衡液预处理吸附柱备用:使用平衡液预处理硅胶膜吸附柱为必做步骤,具体方法参见前文“关于平衡液的使用”
4. 冷却后加入100μL异丙醇,立刻涡旋振荡充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。
注:上述步骤中立刻涡旋或者吹打充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量,必要时如样品粘稠不易混匀时可以涡旋振荡15秒混匀。
5. 将上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一个吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm 离心30-60秒,倒掉收集管中的废液。
6. 加入500μL抑制物去除液IR,12,000rpm 离心30秒,弃废液。
7. 加入600μL漂洗液WB(请先检查是否已加入无水乙醇!),12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
8. 加入600μL漂洗液WB,12,000rpm 离心30秒,弃掉废液。
9. 将吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm 离心2分钟,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。
10. 取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加100μL洗脱缓冲液EB(洗脱缓冲液事先在65-70℃水浴中预热效果更好),室温放置3-5分钟,12,000rpm 离心1分钟。将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,室温放置2分钟,12,000rpm 离心1分钟。
注:洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要DNA浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于30μL,体积过小降低DNA洗脱效率,减少DNA产量。
11. DNA可以存放在2-8℃,如果要长时间存放,可以放置在-20℃。
问题与解决方法:
问题 | 评论与建议 |
DNA产量低 | * 蛋白酶K失效了-建议:收到蛋白酶K后,按照每次使用量分装冻存,避免反复冻融。 * 裂解不完全或者和异丙醇没有充分混匀-建议:加入结合液后,和加入蛋白酶K后立即吹打或者涡旋混匀;加入异丙醇后立即吹打或者涡旋混匀才加入吸附柱,如果太粘稠必须涡旋振荡15秒充分混匀。 * 有的革兰氏阳性菌需要特殊的酶裂解-建议:请详细参见步骤3,了解提取细菌的特性。 |
未提取到DNA | * 漂洗液WB中忘记加无水乙醇-建议:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。 |
洗脱下来的 DNA产量低 | * 离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇-建议:确保做了步骤9,否则残留乙醇会影响洗脱效率。 * 使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液-建议:仔细阅读仔细阅读注意事项6和步骤10和只使用洗脱缓冲液EB洗脱。 |
A260吸光值 异常偏高 | * 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。 |
DNA下游酶切 不能切开或者 酶切不完全 | * 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应-建议:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。 * 离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应-建议:确保做了步骤9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。 |
品牌: | 爱普科学 |
产品别名: | AipBest Bacterial Genome DNA Rapid Extraction Kit(Centrifugal Column) |
规格: | 50T/100T/200T |
性状: | 液体 |
储存温度: | RT |
保质期: | 12个月 |
产品说明: | 收到产品后,请尽快按照试剂盒内各组分的储存温度保存! |
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